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Pourquoi la métagénomique?
La métagénomique permet d’analyser exhaustivement la composition taxonomique d’une communauté d’organismes. Elle apporte des informations précises sur sa diversité ainsi que sur ses spécificités génétiques.
Comment on peut identifier des espèces grâce aux séquences ADN (= métagénomique?
Le DNA barcoding a pour but d’avoir pour chaque espèce une séquence ADN (environ 500 à 600 nucléotides) qui lui est spécifique et qui permet de l’identifier (un peu comme un code bare).
Comment la métagénomique a révolutionné la mesure de la biodiversité?
Combinant les avancées du séquençage à haut débit et du big data, la métagénomique a bouleversé notre vision du monde microscopique en dévoilant l’incroyable biodiversité des écosystèmes microbiens, qu’ils résident dans les fonds marins, sous terre ou dans nos intestins…
Comment fonctionne la métagénomique dans l’environnement naturel?
Grâce à une analyse très fine des communautés microbiennes présentes dans l’environnement naturel, la métagénomique peut être mobilisée pour l’analyse de la qualité de l’eau, le développement de biocarburants, de produits agrochimiques, la remédiation des sols ou la mise au point de nouvelles pratiques de culture ou d’élevage.
Quel est le principe de la métagénomique?
Le principe de la métagénomique étant d’analyser le pool génomique des communautés microbiennes sans avoir à isoler préalablement les microorganismes, cette approche permet ainsi de mieux comprendre l’organisation des communautés microbiennes et le rôle écologique des microorganismes qu’elles contiennent.
Quelle est la différence entre la génomique et la métagénomique?
Une autre différence majeure entre la génomique et la métagénomique réside dans les données. En métagénomique, de multiples espèces sont mélangées dans les données mais chaque espèce n’est pas représentée de la même manière dans l’échantillon.
Comment procéder à l’analyse métagénomique?
L’analyse métagénomique peut être réalisée selon 2 approches : par le séquençage d’un ou plusieurs gènes particuliers, appelé barcode/ etiquette, commun à plusieurs espèces.